Bioremediation ist eine vielversprechende Strategie für die nachhaltige Sanierung kontaminierter Standorte, insbesondere bei Kontamination mit organischen Kohlenwasserstoffen. Der Schlüssel zur Identifizierung optimaler Bedingungen und die Vorhersage des Abbaus im Untergrund ist das Verständnis der mikrobiologischen, geochemischen und physikalischen Transportprozesse sowie deren Zusammenhänge.

Im Rahmen des EU-geförderten Projekts MiBiRem, entwickeln wir ein Open-Source-Python-Framework MiBiPreT zur Analyse und Vorhersage von mikrobiologischen Abbau- und Transportprozessen. MiBiPreT besteht aus mehreren Paketen zur Datenanalyse, Interpretation und Modellierung hydrogeologischer/geochemischer Prozesse organischer Schadstoffe, mit Fokus auf aromatische Kohlenwasserstoffe, während des mikrobiellen Abbaus.

Wir stellen die einzelnen Pakete mibiscreen und mibitrans vor. Mibiscreen dient der mikrobiombasierten Felddatenanalyse im Rahmen der Sanierung. Es umfasst Screening-Methoden und Datenvisualisierung für geochemisches Screening, Metabolitenanalyse, Isotopenanalyse und multivariate Statistik. Mibitrans ist für die Modellierung von Stofftransport und biologischem Abbau konzipiert. Es basiert auf physikalisch basierten (semi-)analytischen Lösungen für den mehrdimensionalen Stofftransport. Der biologische Abbau kann sowohl als einfacher Zerfall erster Ordnung als auch als instantane, feldweite Reaktion auf Basis der Elektronenakzeptorkonzentrationen modelliert werden. Beide Pakete sind modular, umfassend getestet, gut dokumentiert und strukturiert, um eine einfache Anpassung und Anwendung in verschiedenen Feldsituationen zu ermöglichen. Wir werden ihre Anwendung anhand von Beispieldaten laufender Bioremediationsprojekte vorstellen um zu zeigen, dass beide Pakete - mit ein wenig Pythonkenntnissen - leicht zu nutzen sind, sowohl für Wissenschaftler als auch für Praktiker.